日治時期
| 校名 | 校址 | 創立時間 | 校長姓名 | 校長就任起迄時間 |
| 台東廳呂家公學校 | 台東廳南鄉呂家社 | 明治39年 (1906) | 松浦尚次郎 | 明治39年 (1906) |
| 菖浦竹一 | 明治40年～明治43年 (1907~1910) | |||
| 橋本喜源太 | 明治44年 (1911) | |||
| 丸尾義淨 | 明治45年～大正5年 (1912~1916) | |||
| 台東廳呂家蕃人公學校 | 大正6年 (1917) | 丸尾虎之助 | 大正6年～大正10年 (1917~1921) | |
| 台東廳呂家公學校 | 大正11年（1922） | 無 | 大正11年～大正12年 (1922~1923) | |
| 佐藤鏡太郎 | 大正13年～昭和2年 (1924~1927) | |||
| 久保一郎 | 昭和3年～昭和4年 (1928~1929) | |||
| 後藤信一 | 昭和5年～昭和10年 (1930~1935) | |||
| 台東廳利家公學校 | 臺東郡卑南庄 | 昭和13年（1938） | 杉山守位 | 昭和11年～昭和13年 (1936~1938) |
| 台東廳利家國民學校 | 昭和16年（1941） | 井上書雄 | 昭和14年～昭和16年 (1939~1941) | |
| 菅野太助 | 昭和17年～昭和19年 (1942~1944) |
中華民國時期
| 校長姓名 | 校長就任起迄時間 |
| 林再成 | 民國35年4月18日～民國36年2月19日 (1946/4/18~1947/2/19) |
| 袁克藤 | 民國36年2月19日～民國36年3月4日 (1947/2/19~1947/3/4) |
| 李奎芳 | 民國44年8月31日～民國47年9月16日 (1955/8/31~1958/9/16) |
| 王添丁 | 民國47年4月14日～民國48年9月10日 (1958/4/14~1959/9/10) |
| 胡寶鈴 | 民國48年9月10日～？ (1959/9/10~ ?) |
| 王注來 | 民國58年9月22日～民國62年10月26日 (1969/9/22~1973/10/26) |
| 陶源濬 | 民國62年11月16日～民國69年2月1日 (1973/11/16~1980/2/1) |
| 毛兆翔 | 民國69年1月19日～民國76年7月31日 (1980/1/19~1987/7/31) |
| 莊茂榮 | 民國76年8月26日～民國84年7月31日 (1987/8/26~1995/7/31) |
| 王英州 | 民國84年8月1日～民國88年7月31日 (1995/8/1~1999/7/31) |
| 張中元 | 民國88年8月1日～民國95年7月31日 (1999/8/1~2006/7/31) |
| 黃劍陽（代理校長） | 民國95年9月1日～民國96年7月31日 (2006/8/1~2007/7/31) |
| 黃正元 | 民國96年8月1日～民國104年7月31日 (2007/8/1~2015/7/31) |
| 許忠文 | 民國104年8月1日～民國108年7月31日 (2015/8/1~2019/7/31) |
| 林庭瑤 | 民國108年8月1～迄今 (2019/8/1~ ) |
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